O'Reilly Media Навыки работы с данными в биоинформатике: Практическое руководство по использованию открытых инструментов для анализа

Изучите навыки, необходимые для преобразования крупных наборов данных секвенирования в воспроизводимые и надежные биологические результаты. Это практическое руководство научит вас использовать свободно доступные открытые инструменты для извлечения смысла из сложных биологических данных.

Вдобавок, ни в одно другое время в истории человечества наша способность понимать сложности жизни не зависела так сильно от умения работать с данными и их анализировать.

Эта книга среднего уровня обучает общим вычислительным и аналитическим навыкам для анализа биологических данных. Если вы знакомы с языком программирования, таким как Python, вы готовы начать.

• Перейдите от решения простых задач с неаккуратными скриптами к решению крупных проблем с помощью умных методов и инструментов.
• Обрабатывайте данные биоинформатики с помощью мощных пайплайнов Unix и инструментов для работы с данными.
• Изучите методы исследовательского анализа данных на языке R.
• Используйте эффективные методы работы с диапазонами геномных данных и операциями с диапазонами.
• Работайте с распространенными форматами файлов геномных данных, такими как FASTA, FASTQ, SAM и BAM.
• Управляйте своим проектом в биоинформатике с помощью системы управления версиями Git.
• Справляйтесь с трудоемкими задачами обработки данных с помощью Bash-скриптов и Makefiles.